Pada hewan, gejala avian influenza bervariasi baik dalam kaitannya dengan strain virus yang terlibat dalam infeksi maupun pada spesies yang terpengaruh. Pada unggas, khususnya, infeksi memiliki arah yang jinak, jika disebabkan oleh virus patogen rendah yang dimiliki oleh semua subtipe H ( LPAI - Pengaruh Avian Patogen Rendah ). Penyakit yang disebabkan oleh virus LPAI terlokalisasi dan ditandai oleh gejala pernapasan dan enterik, sering dikaitkan dengan kelesuan umum, robek dan kelainan reproduksi pada hewan ternak (mis. Perubahan telur dan penurunan bertelur).
Sebaliknya, beberapa jenis virus yang termasuk subtipe H5 dan H7 dapat menyebabkan influenza avian patogenik yang tinggi ( HPAI - Pengaruh Avian Patogen Tinggi ), penyakit yang selalu sistemik dan serius, terkait dengan kematian tinggi antara beberapa spesies burung liar dan domestik. Gejala yang paling jelas adalah di sistem saraf, dengan depresi sensorik, rotasi kepala ke belakang dan kelumpuhan sayap.
