Biji kopi, selama pemrosesan industri, juga dapat digunakan untuk produksi kopi tanpa kafein. Proses ini, yang disebut dekafeinasi, terjadi ketika bijinya masih hijau dan tidak setelah dipanggang. Banyak metode yang dapat diterapkan untuk menghilangkan kafein dari kopi, tetapi semua termasuk perendaman biji hijau dalam air panas (proses yang dikenal sebagai proses air Swiss) atau uap; pada titik ini, ditambahkan pelarut yang melarutkan dan memisahkan minyak yang mengandung kafein dari biji. Dekafeinasi sering diterapkan oleh pengolah kopi yang, sebagai sumber penghasilan tambahan, menjual kafein ke perusahaan farmasi.
