Ensefalitis Jepang tersebar luas di hampir seluruh Asia dan di beberapa wilayah Oceania. Risiko tertular infeksi pada umumnya terbatas bagi sebagian besar pelancong, namun tujuan, periode menginap dan kegiatan yang dilakukan selama menginap harus dipertimbangkan.
Daerah-daerah yang berisiko berada di atas semua daerah pedesaan dan pertanian, khususnya yang diperuntukkan bagi penanaman padi, di mana penyakit ini endemik. Namun, kasus yang dekat dengan atau di dalam pusat kota tidak jarang, jika kondisi yang mendukung perkembangan nyamuk ada.
Di Asia Tenggara, risiko sakit melalui gigitan nyamuk yang terinfeksi ada sepanjang tahun, dengan penekanan pada korespondensi hujan monsun sampai awal musim kemarau; di daerah beriklim Cina, Jepang dan semenanjung Korea, bagaimanapun, transmisi lebih besar dari Mei hingga September (periode aktivitas pembawa yang lebih besar). Saat bepergian ke daerah endemis, vaksinasi dapat direkomendasikan.
