Virus Marburg mengambil namanya dari kota Jerman dengan nama yang sama dengan tempat pertama kali muncul pada tahun 1967, ketika menyebabkan tiga wabah serentak di Jerman (kota Marburg dan Frankfurt) dan di bekas Yugoslavia (Beograd). Di kedua negara, virus Marburg mungkin diperkenalkan dengan impor monyet hijau Uganda ( Cercopithecus aethiops, juga dikenal sebagai Cercopiteco Grey-green).
Kasus pertama dicatat di antara staf laboratorium yang memiliki kontak erat dengan primata ini. Kasus sekunder melibatkan tenaga medis di rumah sakit yang terpapar bahan biologis yang terinfeksi.
Selanjutnya, episode atau wabah sporadis dicatat di Afrika Selatan, Kenya, Republik Demokratik Kongo dan Angola, dengan total sekitar 600 kasus dan 480 kematian.
