Asam amino dan sintesis protein biasa
Asam amino yang paling sering muncul dalam struktur protein organisme hidup disebut asam amino biasa atau proteinogen. Meskipun lebih dari 500 jenis asam amino dikenal di alam, hanya ada dua puluh yang kita sebut biasa. Seiring dengan ini, ada beberapa yang lebih jarang, yang disebut sesekali, yang umumnya berasal dari metabolisme yang biasa setelah penggabungan mereka ke dalam rantai protein. Dalam kolagen, misalnya, lisin dan prolin, dua asam amino biasa, ditemukan dalam bentuk terhidroksilasi (hydroxyproline dan hydroxylisine).
Sebagian besar asam amino tidak biasa lainnya jatuh terutama ke dalam konstitusi enzim dan hormon protein alam, atau lebih tepatnya peptida (ingat bahwa untuk dipertimbangkan seperti itu, protein harus terdiri dari lebih dari 100 asam amino, sementara untuk membentuk oligo dan satu polipeptida sudah cukup dari 2 hingga 9 dan dari 10 hingga 100).
Di antara 20 asam amino biasa yang diingat
Alanin, Arginin, Asparagin, asam Aspartat, Sistein, Glisin, asam Glutamat, Glutamin, Histidin, Isoleusin, Leusin, Lisin, Metionin, Fenilalanin, Prolin, Serine, Threonine, Tryptophan, Tyrosine, Valine
Contoh asam amino tidak biasa adalah:
karnitin (terlibat dalam pengangkutan asam lemak rantai panjang di dalam mitokondria, di mana mereka digunakan untuk menghasilkan energi);
ornithine, citrulline dan homocysteine (berpartisipasi dalam metabolisme asam amino - siklus urea);
hydroxyproline dan hydroxylisine (bagian dari komposisi kolagen dan beberapa protein);
sarcosine (atau methylglycine).
Beberapa asam amino juga memiliki kepentingan komersial atau farmakologis.
- Sodium glutamat digunakan dalam industri makanan sebagai penambah rasa (lihat stock cube).
- L-dihydroxyphenylalanine (L-DOPA) adalah obat yang digunakan untuk mengobati penyakit Parkinson.
- 5-hydroxytryptophan (5-HTP) telah digunakan untuk pengobatan gejala neurologis yang terkait dengan fenilketonuria (penyakit metabolisme bawaan yang mencegah penggunaan fenilalanin, asam amino esensial, karena defisiensi enzim tertentu; akumulasi fenilalanin dalam jaringan itu bertanggung jawab atas kerusakan serius pada kulit dan neurologi).
Tumbuhan dan bakteri mampu menghasilkan asam amino tertentu, yang dapat ditemukan dalam antibiotik peptida, seperti nisin dan alameticin.
Asam amino esensial
Beberapa dari 20 asam amino biasa disebut esensial, karena tidak dapat disintesis oleh tubuh dari senyawa lain, tetapi harus dikonsumsi bersama makanan.
Bagi manusia, ini adalah fenilalanin, leusin, isusin, lisin, metionin, treonin, triptofan, valin, dan, pada anak-anak, histidin dan arginin.
Asam amino biasa, karakteristik kimia
Menurut karakteristik kimiawi dari radikal R (kelompok atom yang membentuk rantai tidak terlalu panjang), asam amino dapat dibagi menjadi berbagai kategori.
Asam amino dengan apolar R (tidak dapat membentuk ikatan hidrogen):
dengan rantai alifatik: alanin, leusin, isoleusin, valin, prolin
dengan rantai aromatik: phenylalanine, tryptophan
dengan rantai yang mengandung atom belerang: metionin
Asam amino dengan polar R:
dengan kelompok OH: serin, treonin, tirosin
dengan grup SH: sistein
dengan kelompok CO-NH 2 : asparagine, glutamine
dengan H: glisin (satu-satunya asam amino non-kiral)
Asam amino dengan basa R:
lisin, arginin, histidin
Asam amino dengan asam R:
asam glutamat, asam aspartat
